Si no me equivoco GoG tiene downloader propio, es decir, con tu cuenta te puedes bajar los juegos, como en los demás sitios (EA y su EADM, direct2drive con el Gamespy Comrade, Steam como no xD y el Xfire creo que también)
No tengo experiencia con GoG, pero, de sentido común es, que de por si te lo puedas bajar tranquilamente, ya que es tuyo digital, y funciona como tiene que funcionar, no está ligado a ningúna parafernalia de GoG a partir de la finalización de su descarga, al menos los demás son asi, no creo que tengas problemas.