Creo q el 1º error, es porq no les pones los caminos bien. Cada edificio tiene una flechita o varias (cuando lo seleccionas para construirlo) y por esas flechitas es por donde tienes q poner un camino, asegurate q por ese camino se puede llegar hasta un almacen, y entonces iran automaticamente a recoger lo q les haga falta, tambien asegurate de que no lo tengas parado (dentro de las propiedades del edificio).
[EDITO]
A lo mejor te hace falta algun material mas para hacer los arcos, como cuerdas o algo asi ( es q no me acuerdo), metete dentro del edificio y mira los recursos q encesita y consigueselos.
Para colonizar otra isla, y construir otro almacen, tienes q llevar tambien ladrillos q creo q no has puesto q llevas, y entonces te acercas a la costa de una isla (en la q no haya otro almacen enemigo cerca) y lo pones en donde quieras (siempre en la costa)
Creo q con esto solucionaras tus problemas
Chao