Hola, a pesar de que será lo más tópico, puede tratarse de que la opción "Wake on Lan" está activada en la Bios, y por eso el ordenador despierta automáticamente cuando se produce una actividad en la red, en este caso imagino que se tendría que desactivar
http://es.wikipedia.org/wiki/Wake_on_LAN (hace años se llamaba "Wake on Ring")
Desde la Bios, en el menú principal, entra en uno de estos submenús (será diferente dependiendo del tipo de Bios)
-
Power /
Power Management Setup -
IRQ Event activity Detect -
Advanced y dentro, ajusta la opción "
Wake on LAN" / "
Modem ring resume"" en "Disabled", para deshabilitar el encendido remoto. Guardar los cambios y reiniciar.
A modo de alternativa a compartir los archivos en red de forma tradicional, podéis revisar
Skydrive, o Dropbox, tal vez lo facilite.
Saludos