No creo que la solución sea tapar las paredes y dejar las moscas ahí. Quieras o no van a seguir estando ahí si no las matas y con el tiempo encontrarán otra salida o se fabricarán ellas mismas un sitio por donde salir.
Mi consejo: Si vas a abrir la pared por la humedad o esperas a que venga el fontanero o empiezas tu mismo tirando pared en los puntos por donde salen. Una vez abierta y localizado el criadero, usa insecticida, bombas o lanzallamas, lo que quieras, pero ten presente que si cada dia te aparecen unas 50 nuevas, dentro de la pared puede haber perfectamente unas 1000 o más, que a su vez esten criando y tengan millones de huevos. Sobretodo si la pared es un gran foco de humedad.
Suerte!