Son prejuicios por parte de muchos y como vendedor buscara venderte lo mas caro.
En general, es cierto que intel tiene mejor rendimiento que AMD, entendiendose por rendimiento a que tiene un mayor IPC, que mas claramente, quiere decir, que un procesador intel procesa mas instrucciones y datos por segundo que un AMD. Ahora la realidad, es que tambien depende lo que vayas a hacer, porque si es una PC para aplicaciones de ofimatica, navegacion web y reproduccion de video, te da lo mismo AMD que intel, te dara lo mismo que si es un procesdador mas caro o si es el procesador mas barato de AMD o Intel.
Para juegos, tambien dependen tus pretensiones, que si es una PC economica pero que te sirva para juegos sin ser muy exigentem, te servira mas un AMD APU que un Intel Pentium o Intel corei3 [todos estos traen el video integrado en el procesador]. Si es para jugar y ser mas exigente, pues ya un AMD FX 6300 o un FX 8320/8350/8370 te servira bien como te serviria un intel corei5.
Si es para maquinas virtuales, te servira mas un FX 8320/8350/8370 que un i5 o i7
Si es para diseño grafico o edicion de video, si quieres el render [creacion de imagenes] mas rapido pues vas por un intel i5 o i7, pero si puedes esperar unos pocos minutos mas, un FX 6300 o FX 8320/8350/8370 te srive perfecto...
Y asi.
Pero la palabra clave es 'depende' de que tipo de trabajo o tareas vas a realizar en la PC y que si la prioridad es el tiempo mas corto.
A todo esto, ¿que tipo de trabajo haras en la PC?, con eso seria facil dar sugerencias de una u otra compañia de procesadores [AMD o Intel].