un pin dentro del PCIe es prácticamente imposible repararlo, lo único que puedes hacer es sustituir el slot entero (el pláctico con todos los pines) y soldarlos a la placa completamente...un trabajo de chinos jaja, pero no muy dificil de hacer si tienes unos ligeros conocimientos de soldadura...
por otro lado, aunque no muevas la gráfica, esta siempre hace fuerza sobre el slot de pcie (por el peso) y sino está bien sujeta con tornillos, puede hacer que los pines se rompan o incluso arrancar el slot entero (cosa rara,pero se ha visto)
cuando veas como está el pin cuelga una foto mejor, para ver como está y aconsejarte mejor, pero no creo que tenga arreglo a no ser que sustituyas toda la pieza
Saludos!