Sí, a lo largo de mi convivencia con cacharros electrónicos han habido un montón de casos sin resolver que desquiciarían hasta al mismísimo dalai lama. Lo que he aprendido es que en el tema de hardware no existe un "o funciona o no funciona", sino que es un "a veces va y a veces no va".
Respecto al olor de la placa ya da igual, la caja usb la voy a jubilar, no vaya a ser que un día me explote en la cara

Respecto al tema principal del hilo, el sonido al apagar el disco duro... Esta tarde he hecho unas pruebas con la caja nueva y no sé qué conclusión sacar. De funcionar funciona, todo correcto, el disco duro no creo que esté arañado, los datos están en su sitio y no he notado nada anormal.
Termino de trabajar con el disco duro, expulso la unidad de forma segura (windows), el motor del disco sigue girando, dejo un tiempo prudencial "por si", al final decido darle al botón de la caja para que el disco deje de girar y se apague, cuando el interruptor cambia de posición el disco duro hace como un "shiii" como si chillara, que dura un segundo o menos, y acto seguido ya deja de girar como hacen todos los discos duros cuando se apagan. Pues ese "shiii" es el que me tiene mosca.