Problemas que puedas tener:
1: Puente. Las silletas del puente estan adelantadas o atrasadas segun la cuerda. Esto se hace para quintar la cuerda. En el puente de tu strato lo mas seguro es que tengas la silleta de la gorda hacia atras y la fina hacia delante. Si cambias las cuerdas tendias que cambiar la posicion y altura de las silletas.
2: Pastillas. No creo que tengas problemas. Desconozco si algunas tienen algunap arte modificada para captar mejor agudos en las finas y graves en las gordas. Las vintage estilo fender suelen tener el centro levantado, pero da igual.
3: Cejuela. Claro, tendras problemas con los surquillos de la cuerda. Tendrias que limar donde pasa la fina para que pase la gorda y posiblemente la fina te cerdeé por el surco de la gorda.
En fin, jimmy hendrix era zurdo y tocaba en una para diestros cambiando las cuerdas. Sonar, sonarás xD