a ver, si arrastras y no funciona es que el tema no esta bien hecho o que dentro del paquete comprimido, hay mas paquetes comprimidos (variantes del tema?) o cosas asi.
el tema de que las aplicaciones de root se vean diferentes es porque lo que pones en .themes o .icons esta en tu carpeta personal, que solo usas tu, y nadie mas, ni root. y si en deviantart cuelan algo "maligno" y lo usas para todo el sistema, agarrate. y no es una locura, ya paso que un screensaver de gnome-look, distribuido en un .deb tenia penes porculadores que porculaban el sistema de quien lo instalara... pero claro, la gente lo instalaba tan pancha.