La solución creo q también está en unos pekeños ficheros de 4 bytes q se llaman doa1 o doa2.
Si está solamente el doa1, arrancará el doa1, si está solamente el doa2, arrancará el doa2. En cambio si estan los dos ficheros, arrancará el doa1 (creo q era asi). Me pasó a mi, y si sabes como funciona el tema los puedes poner en un mismo DVD con un menu (mediante MSM o smilares) para elegir el 1 o el 2.