No das muchas explicaciones, que es lo que tienes? el programa en si? una GUI???
NO ME SEAIS VAGOS Y USAD LA LINEA DE COMANDOS!!!!!
Si es que tampoco es tan dificil...
Abris el simbolo del sistema, vais a la carpeta (que habreis copiado la dirección del explorador)
cd c:\.....\ctr-cgs\
si no esta en la unidad c:
unidad:
ejemplo
e:
una vez alli, ya estais listos para ejecutar el ctr-cgs.....