Matroska es un contenedor de video (como el avi, el ogm, etc.) bastante más avanzado que los anteriores y además libre.
Su página oficial la tienes
aquí. Si quieres saber con detalle qué prestaciones ofrece puedes verlo en
esta guía.
Si, como imagino, usas windows y quieres el codec, puedes conseguir
aquí todos los codecs.
Ya de paso, te recomiendo que bajes el Media Player Classic, que viene con soporte de serie para Matroska.
Obviamente, para linux el soporte de matroska funciona perfectamente con mplayer, xine y videolan instalando las librerías correspondientes.
salu2