Pues por fin he conseguido actualizar, he tenido que entar en la pág. del rooter y desactivar el firewal, no tenia ni idea que estaba activado, ya que tengo conectados teléfonos, psp, la ds lite, Wii, 360, ps3 etc y no me había pasado esto nunca, siempre se conectan a la primera y sin problemas, pero parece que la 3DS es mas caprichosa, en fin, ya era hora.