m... yo creo que he entendido tu pregunta..
m.. a ver, hay 2 soluciones, con el TMPEGENC demultiplexas el video del sonido y "a ojo" calculas cunato tiempo se atrasa o se adelanta...
y cojes el audio y con el goldwave le vas poniendo/quitando ms de silencio de delante, vuelves a multiplexar y vas probando (si, palizón)
otra solución es volver a comprimir el mpg, y en source Range (en el TMPEG ENC) hay una opción ke es algo así como "audio GAp correct" (bueno,algo de audio lleva) y le vas poniendo + o - ms hasta que las ondas de sonido coincidan + o menos con la imagen..
(espero ke me hayas entendido)
PD:ms=milisegundos