Una cosa por aclarar, en horizontal ventila mejor, por mucho que parezca que la superficie donde está apoyada esté menos caliente. Es normal ya que tiene menos superficie expuesta. Pero por el propio principio físico del flujo del aire caliente, éste va hacia arriba y si tienes un ventilador que en horizontal justo lo tira hacia arriba, pues no queda nada de aire caliente dentro, y el volumen se rellena con aire que entra desde las rendijas (que no se va a formar un vacío vamos).
Además de que así el aire caliente no pasa por el lector al subir.
Otra cosa es que esté preparada para ponerse en vertical, si se ha diseñado para ello no significa que por ponerla en vertical se vaya a estropear por temperatura.