Primero:
NO COGAS UNA R4 (Flashcard). Hace bastante que el team dejó de actualizarla, y al estar desactualizada, algunas cosas dan problemas.
Segundo: Para cargar backups, no necesitas modificaciones caseras: Solo tienes que comprar una tarjeta que se mete como un juego normal en el SLOT 1 (O el SLOT 2, el de GBA), con una ranura para micro SD, por ejemplo, en la que le metes el firmware correspondiente (Depende de cada flashcard), los juegos, los homebrews...
Tercero: De hacerle una modificación, solo hay un chip, y tampoco es tanto: Se basa en un chip que permite usar el X y el Y en modo GBA, para cambiarlos por el R y el L.
Pasate por el subforo de
flashcards para ver cual te coges mirando las reviews.
Yo te recomiendo un M3 Real, un Cyclos Ds, o una Acekard 2.1, puesto que son las más actualizadas, y de las que más te puedes fiar (Las mejores, en definitiva.)