¡Hola Siego!
¿De cuanto GB es el DD mecánico que quieres utilizar como secundario? ¿Planeas ponerlo en una carcasa externa o quieres almacenar los ficheros utilizando un adaptador SATA/IDE - USB?
A los 4 Gigas que escribiste que soporta el FAT, tienes razón, pero éste es el tamaño máximo de un archivo autónomo que puede soportar el formato de FAT32. La partición máxima en este tipo de tabla de particiones es 32 gigas y de ahí el nombre - FAT32. La situación es distinta con el formato de exFAT que soporta particiones mayores de 32 GB pero no se recomienda en todas las ocasiones, ya que la integridad de los datos podría ser inestable. Si planeas utilizar el disco en ambos sistemas operativos, él debe ser particionado en NTFS - para la partición para Windows y en HFS+ para la partición que se va a usar en el MAC. Si el disco es menos de 2 TB, te recomiendo elegir la esquema de MBR o la segunda opción de las que has puesto por arriba.
Si fuera en tu lugar inicializaría en disco en MBR y haría la partición de Windows primero y, a continuación, haría la segunda partición en HFS+ después.
Espero haberte ayudado. Saludos.