se instala como instalaste el Backup Manager, es decir, desde un USB y arrancando la PS3 en Debug con un Dongle.
Además, siempre es aconsejable sobreescribir la versión vieja por la nueva sin eliminar, porque si eliminas desde el XMB el Backcup Manager, o el Open Manager, etc... también te elimina la carpeta del programa, por lo tanto pierdes las copias de seguridad que tengas en el disco duro interno de tu PS3.
un saludo