Lo he preguntado en el hilo FAQ - Twilight Chainloader Hack, pero no me han contestado, y veo que aquí también pasa:
Mi tele es compatible con 60Hz, es más, puedo jugar al Zelda en 50 y 60Hz sin problemas (utilizo el cable que venía con la Wii). Lo que ocurre es que cuando ejecuto homebrew en 60Hz, ¡se pone en blanco y negro!. No me molestaría ponerlo en 50Hz, pero es que los emuladores van muchísimo más lentos...