Yo tengo el wiifree y aún no se si dejarlo externo (bajo la tapa de la ranura USB) o interno, pero lo que le voy a poner es un jumper al V+ en la parte inferior de los puertos USB, para poder desconectarlo sin tener que andar metiendo y sacando el chip en el zócalo, que siempre hay riesgo de doblar alguna patilla y que se acabe rompiendo.
Por cierto, haciendo pruebas con este sistema, si saco el jumper una vez arranca el juego, el backup me sigue funcionando. Espero que os sirva de ayuda a lo que os lo trabajais.