Todo depende de a qué llames cFirmware... pero, por ejemplo, si llamamos Firmware al System Menu, para empezar, Waninkoko no ha sacado su propio menú, ni siquiera corre el menú de 4.0 bajo un cIOS ni nada parecido.
Básicamente, el método es poner un cIOS que no se borra al actualizar porque Nintendo no quiere (no porque se haga nada especial), actualizar "manualmente" los IOS nuevos y el SM y poco más.
Luego... cual es la diferencia con la 4.0 normal con cIOS y HBC? Pues básicamente que conservas unos cuantos IOS oficiales desactualizados, cosa que solo consigue que todos los juegos te pidan actualizar.
Aparte de esto, parchea IOS60 (aunque esto lo hace con otro programa creo), cosa que se puede hacer teniendo la oficial y listo. No hay absolutamente nada nuevo ni aporta absolutamente nada, simplemente te instala de forma oficial lo que cree conveniente en lugar de la actualización completa.
Yo a esto el único problema que le veo es que hay ya muchos casos que han tenido problemas después de usar el Método de Waninkoko, aunque no digo que sea el culpable, sin duda, a mi me basta para preferir otros métodos, pero vamos, que de esto a un custom firmware hay un rato.
Finalmente, lo más parecido a un cFirmware que existe en Wii a dia de hoy es SoftMii, que con SoftMii Tweaks y demás, si se podría considerar un cFirmware.