Pues creo que esta claro no? la musica en mp3 esta comprimida, y despues al pasarlo otra vez a CD se vuelve a descomprimir, por lo que la calidad baja, y la distorsión supongo que será por la manera de compresión del mp3 que suprime los "picos" mas bajos que estan delante de otros, mas o menos es esto, una posible solución, seria el pasarle filtros al mp3, aunque no se si funcionaría, Otro motivo de la distorsión, puede ser el codec con el que se hizo el mp3, y si se utilizaron correcciones jitter, por ejemplo.
Espero servirte de ayuda, hasta otra