Sobre la encriptacion... solo un apunte.
Obviamente la Wii lo desencripta para ejecutar, y dudo que desencripte on-fly, esto es paso a paso, cuando esta ejecutando (por la velocidad, claro), ergo desencriptara, almacenara, ejecutara y borrara, en ese orden. ¿donde? En la memoria interna.
Entonces puedo aventurar que cuando se consiga cargar programas será porque se interfiere ese proceso para saltarse el paso de desencriptacion y cargar ROMs o programas no encriptados en la memoria donde almacena y ejecutar.
Alternativamente puede ser que alguien ataje el firmware para eleminar ese paso. Digamos que eso sería una variante de como funcionan los chips de PS2 o los trucos de PSP.
Pero vamos que todo esto de momento son elucubraciones de gente, como yo, que aun no tiene la consola.