A ver...
Cuando dice amplificador wifi, entiendo que te refieres a un Access Point wifi ¿No?
¿Qué configuración de canales utilizas? Un AP debe estar utilizando (en banda 2,4 que dices utilizar) en un canal que esté a más de dos del que utiliza el router, para que no interfieran uno con otro. Y a su vez, obviamente, que no te pise con vecinos cercanos por el mismo motivo. Así que si por ejemplo en el router tienes el canal 6, el repetidor debe usar del 3 hacia abajo o del 9 hacia arriba (esto contando con que el ancho de banda del canal lo tengas a 40mhz. Si lo tienes a 20, cada wifi sólo pisa un canal arriba y abajo en vez de dos). Al final tienes que pensar que un Access Point es una red wifi completamente independiente de la principal (por más que uno le pueda poner el mismo nombre) y hay que cumplir con todo lo típico para evitar interferencias.
Si con amplificador te refieres a un nodo mesh, y no lo tienes cableado, la wifi es normal que se resienta muchísimo si no tiene una red dedicada para blackhaul (para el tráfico entre en nodo y el router).