¿Alguno ha probado a darle a probar la conexión wifi, que detecte la actualización y cancelarla? Según había leído, lo hará en segundo plano permitiéndote usar la consola de forma normal, una vez descargada, ya te avisa de la actualización disponible lista para instalar, de forma similar a lo que hace 3DS...
Por cierto, leyendo un poco los avisos legales (la primera vez que lo hago), hay un apartado que dice que Nintendo puede actualizarte la consola de forma automática cuando quiera...