Duda con Time Machine

Buenas, voy a instalar Mavericks y queria hacerlo formateando el disco duro, pero como no tengo tiempo de estar instalando de cero todos los programas voy a restaurar una copia de Time Machine.

El caso es que tengo dos discos duros, uno para datos y otro para el SO y los programas. Y yo solo voy a formatear el del SO.

Entonces mi duda al restaurar desde Time Machine, ¿tendré algún problema con el disco de datos? El TM está configurado para que haga copia de seguridad de ambos discos, por eso no sé qué hará al encontrarse con uno que tiene que restaurarlo entero pero el otro está tal cual.

Gracias
Una vez que tengas maveriks, al configurar el primer arranque puedes migrar los datos de la partición del so sin hacer nada mas, importando configuraciones, archivos y programas.

Un saludo
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