Si te fijas, cuando cierras dicho proceso, seguro que también se cierra una pestaña o algún elemento de una de las webs, Java o Flash por ejemplo... al cerrarlo sólo afectará a la pestaña que lo estuviera usando, por eso en teoría sigues tan normal.
Mira si eso te lo hace tras visitar alguna web determinada, me decanto a que te lo hace en alguna que tenga flash...