Como pusiste que tenías un disco duro externo, yo pensaba que te referías a un HDD usb, no a un disco interno conectado a un dock (no leí bien)
Si es un disco SATA lo que tienes, yo lo pincharía a la placa con el cable correspondiente y le haría una prueba de rendimiento a ver como responde en cuanto a velocidades de lectura/escritura. También miraría con Crystal Disk Info o alguna aplicación similar si tiene sectores dañados o reasignados, a ver.