Para que Fogasa te reconozca el pago tienes que hacer antes un acto de conciliacion, si no llegais a acuerdo tu abogado debe presentar los papeles para el juicio, y una vez que tengas sentencia, el abogado debe presentarlos a Fogasa.
por los salarios no te preocupes, el maximo creo que eran 10.000 Euros, el salario que te deban lo cobraras integro, otra cosa es la indemnizacion, dependiendo de los años que lleves trabajados te pagara un 60% Fogasa, antes te reconocian 45 dias por año trabajado, ahora son 25...y los topes de indemnizacion han bajado una barbaridad.
Mi consejo, busca un buen abogado laboralista y que no te cobre mas de un 8%
Mucha suerte y ojala que veas la pasta pronto, a mi me tardaron 2 años.