vamos a ver es bien simple.
1º descargas el mkvmergue gui yo uso la versión 2.8 porque las últimas dan problemas con algunos reproductores.
2º descargas el mkvestract gui2 y lo pones en la misma carpeta donde tengas instalado el mkvmergue.
3º descargas el useac3to, yo tengo un portable.
cuando tengamos todo esto, abres el estract y arrastras la pelicula que quieras y extraes el audio en cuestión.
después abres el useac3 y arrastras el audio pinchas sobre ac3 y despues en 448 yo siempre pongo 640, le das a run command line y tardará un rato. cuando termine ya tendrás tu audio en ac3.
despues abres el mergue y arrastras la pelicula original y arrastras tambien el audio creado y quitas el dts y seleccionas el ac3
un error que te puede dar es con el mergue porque el nombre de origen y el de destino es el mismo, lo cambias y punto.
es muy muy fácil.