Puedes instalar cuantos escritorios y gestores de ventanas quieras, no creo que haya problemas, cada uno tendrá sus archivos de configuración.
Cuando estés en la pantalla de inicio de sesión, seguramente tengas un menú con opciones donde podrás elegir entre gnome, kde, gnome con openbox, etc.
Para actualizar la versión actual de lo que tengas, dependerá de si actualizan los paquetes en tu distribución. En algunas sólo los actualizan con cada actualización del sistema, cada X meses; en otras se actualizan conforme van sacando nuevas versiones.
Si no, puedes buscar paquetes precompilados por otro para tu distribución, tal vez en algún repositorio, o siempre te los podrás compilar tú.