Yo uso el VMBIC_v1_3b - Virtual Multi Boot ISO Creator.
Para funcionar necesitas una bios que soporte multi iso como el Ninjamod2.1, Cobra, Qoob...
El programa ya se encarga de obtener el tamaño exacto de la ISO (1,35). Según la bios, te permite cargar más o menos juegos. Yo solo he usado el Ninajmod y el Qoob por lo que os puedo decir que admitian hasta 5 o 6 juegos.
Tenéis que tener en cuenta los juegos que vais a usar para hacer la iso, ya que unos ocupan más que otros.
Saber que juegos son más recomendados para multi-iso, pues según la calidad del juego. Por ejemplo el Zelda usa practicamente el total de la ISO mientras que el Mario Party 4 ocupa solo unos 400MB.
Son buena idea para juegos de Nintendo64.
Saludos