Si es una falcon (creo que no lo habias mencionado hasta ahora) el J-TAG tiene que ser con diodos por narices.
Al ser el segundo problema, que a veces no arranca, si que tienes algún problema en la instalación y es recomendable que lo soluciones.
Si abres tu nand original con el degraded, que te dice?
Por otro lado, es extraño (como bien dices tu) que esos errores tambien te los de solo con el xell.
Así que solo nos queda: keyvault mal inyectado, badblocks en los primeros 50 bloques o mal flasheo.
El xellous no da errores de flasheo, pero no remapea badblocks, así que casi descartaria un mal flasheo.
Eso nos deja solo lo del keyvault mal inyectado y lo de los badblock.
Si no es nada de eso, no se me ocurre qué otra cosa puede ser.