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@ripsoren Empieza por editar eso de pi,,, ya que no se da soporte en el foro a ello, lo que yo haria seria probar una micro sd vacia solo mete el boot,firm si tienes sighax o arm9loaderhax.bin si estas usando arm9 para que la consola arranque en caso que no tengas el paso de arrancar si sd y prueba como te funciona con una vacia tanto del primero error como del segundo

Tambien para el segundo problema prueba esto que salia en un post Configuración> Gestión de datos> Nintendo 3DS> Software y borrando el archivo de 0 bloques llamado "?"