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No creo yo que nadie capaz de colarse en equipos ajenos se dedique en exclusiva a cambiar texto en un archivo.

La causa por la que ha pasado eso la ignoro, pero personalmente descartaría la intrusión remota.

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¿No será alguna mala pasada del portapapeles? Algo que se pegó sin darte cuenta.
Es que si yo me meto en tu pc, o te robo todo lo que pille o te dejo una nota para que veas dónde está el problema y ayudarte.

El punto intermedio de trolear me parece un poco raro.

¿Alguien de tu entorno con ganas de guasa?
¿Puede ser cosa del propio programa, o algo que hiciste sin darte cuenta?
¿Te fijaste en la fecha en la que se modificó el archivo?
¿Hay algún archivo nuevo en el sistema con fecha próxima (minuto antes o después) al presunto ataque?

Es que ese tipo de ataque es suficientemente gordo como para que el más birria de los antivirus no lo detecte; prueba el ProcessExplorer para examinar al detalle cada proceso y servicio por si realmente algún bicho tipo troyano ya estuviese ahí, pero es que realmente lo dudo.