A mi me pasó, empezó con un pequeño ruido pero terminó en una vibración acojonante. Por EOL me dijeron que seguramente al final mi lector palmaría así que tiré de garantía y NINTENDO me cambió el lector. Ya no ha vuelto a dar problemas.
En cuanto a los Backups de GC, creo que aún no hay loader que los cargue via USB.
Un saludo.