Tienes que instalarlo en la MS, no copiarlo. Una vez instalado, empiezas a cargar aplicaciones en la MS, y cuando arranques el GTA, en el momento que lee carga el juego, tiene que directamente aparecerte el menú del eLoader y todas las aplicaciones que tengas instaladas te aparecerán para escoger. Te aconsejo que utilices alguno de los packs que los eolianos han creado, porque vienen con muchas aplicaciones interesantes. Más o menos aprenderás a utilizar eLoader y después ya cargarás otras cosas que te puedan interesar.
P.D.: te recomiendo el pack de Masual. Bastante completo y con muchos emuladores