¿Bueno supongo que te refieres a actualizar la consola? Si es asi, lo unico que me suena que puedes perder es la posibilidad de cargar juegos de otra region, osea que si tienes una comprada en USA y la tienes en España puedes perder la posibilidad de jugar con los de esta ultima region.
Por otro lado si lo que quieres es actualizar el ModChip de tu consola, primero debes conocer cual tienes instalado y si se puede actulizar via DVD o te toca desmontarlo y programarlo con un programador a tal efecto. En este caso la tarea de actualizar puede estropear el Modchip, aunque hay algunos que se pueden recuperar (Wasabi)
Por ultimo si a lo que te refieres realmente es a que Nintendo a conseguido un metodo para petar lo Chip de la peña pues me haces que me ca...gue vivito, aunque lo dudo, como mucho podria haber posibilidades con los que tiene Softmod y aun asi con un poco de cuidadin lo evitarias.
Aun asi podrias publicar la fuente de la informacion