Los cIOS se suelen instalar en un bloque de la Wii, en el caso del cIOS 38 rev 14 usa el IOS 249 por lo que si instalas en ese mismo bloque un cIOS superior es como si actualizaras, no hace falta desinstalarlo previamente.
Como bien te han dicho, si "no te funciona" seguramente sea por el Error 002. Waninkoko suprimió la corrección de Error 002 a partir de la rev 14 y desde entonces ahora el Error 002 Fix lo suelen hacer las propias aplicaciones. Fijate en el menu de configuración de la que uses para lanzar tus backups si tiene una opción para corregirlo.