Lo primero, si tienes 4.2 en tu consola no necesitas actualizar con nada. Tu consola es válida para el Gateway, porque éste necesita que la consola esté en un firmware comprendido entre 4.1 y 4.5, ambos inclusive. Si tienes 4.2, pues no necesitas nada más.
Por otra parte, el Gateway ejecuta juegos que piden cualquier firmware, incluso más de 5.x ó 6.x, debido a la función de "firmware spoofing" que emula el firmware necesario para que arranque ese juego. No te preocupes, te valdrá cualquier juego, requiera el firmware que requiera. Mismamente el nuevo Zelda o el Bravely Default piden ambos 6.2 y se pueden ejecutar perfectamente con el Gateway, no piden actualizar.
Por último, si actualizas con el juego, la consola quedará actualizada al firmware que traiga ese juego, no a la última versión de Nintendo. Pero insisto, no necesitas hacerlo ya que tu consola está en 4.2 y te vale perfectamente para usar el Gateway.
Resumiendo en pocas palabras: deja la consola tal cual está, que así te vale.