Segun tengo entendido la cube no tenia encriptacion RSA y la Wii si, los backups de wii funcionan porque son una copia 1:1 por lo cual ya esta encriptado y la wii lo desencripta sin problema , pero el homebrew , a menos que se encripte , la wii no podra desencriptarlo y no funcionaria.
Con lo cual el wiinja no va ha hacer que funcione el homebrew , para eso habra que esperar mucho e incluso puede que no llege a haber hombrew para wii por el tema de lo dificil de la encriptacion RSA.