@onthe Antes de nada, deberias pasarle el CystalDisk Info para ver el estado, y si es malo, te recomendaria cambiarlo directamente, y no andar jugando a la loteria con el..... Pero si no hay mas remedio y quieres utilizarlo igualmente....
Te doy una idea:
Usa el HDD Regenerator, hazle un primer pase en modo 'Repair', para que intente reparar los sectores que encuentre 'dañados'. Si detectase algun sector, al final del escaneo te dara un listado de sectores. Apuntalos.
Despues, hazle un segundo pase igual, y si vuelve a detectar sectores, y estos coinciden con alguno de los del primer pase, es casi seguro que esos sectores no tengan solucion facil, por ahora. Una vez identificados esos sectores, es cuando tendras que cambiar de programa (aqui ya te dejo elegir el que tu quieras, cualquier particionador decente servira). Apuntate TODOS los sectores exactos aparte, en un folio, en un txt lo que quieras, apuntando el 'MB nº XXX' de los sectores jodidos (esto para crear un indice de donde estan).
Ahora vete al particionador, limpia el disco por completo, elimina todas las particiones que contenga (ni que decir, que hagas antes backup de datos...) y a continuacion, podras empezar a crear las particiones, pero aislando todos los sectores dañados en zonas que NO tendran particion. dependiendo de la localizacion de los sectores, (si estan muy al inicio, o muy al final, o en el medio) te recomiendo que crees 1, 2 o 3 particiones para asignar el espacio utilizable. No mas de 3 primarias, porque si hay tantos sectores o estan tan repartidos, es un sintoma de que el disco esta empezando a fallar ya de forma definitiva.
Es un proceso muy laborioso y lleva mucho tiempo, pero si no tienes mas remedio que reutilizar ese disco y no te puedes permitir el cambiarlo, al menos asi ganaras algo de espacio extra de almacenamiento. No te recomiendo en absoluto que lo uses para disco de sistema, avisado queda.