Hay gente que le suelda a la placa un portapilas, de esa forma es fácil quitar y poner la pila, además de que le sirven las pilas de los relojes y no tienes que comprar pilas de esas que se sueldan. En el caso de Pokémon Rubí/Zafiro/Esmeralda el espacio para la pila está muy medido, así que no sé si aquí se podría hacer. En cartuchos transparentes de GBC se vería el cambio desde fuera, así que tiene un impacto estético, aunque yo lo recomendaría para quien quiera hacerlo.
Por otro lado, algunos prefieren que en vez de ponerle una pila nueva, le cambian el chip de memoria por uno en formato flash, de forma que no necesitan pila para guardar la partida. En Pokémon Oro/Plata/Cristal igualmente necesitarán una pila para el reloj interno, pero se puede combinar con una memoria flash para que no se vaya la partida.
En GBA la mayoría de juegos usan memoria flash, pero hubo un puñado de los primeros que sacaron que todavía usaban guardado con pila.
Lo que no recomiendo bajo ningún concepto es soldar y desoldar componentes de la placa con el juego y la consola encendida, es muy peligroso para la persona y también para el aparato.