Pues entonces fijo que es de los conectores, o bien del cable o bien de la consola.....inspeccionalos detenidamentea ver de dónde viene exactamente el problema.
Si tienes la GC a mano prueba a ver si te sale todo bien a la primera, si es así entonces es de la entrada de la SNES (al igual tiene algún contaco sucio o oxidado, prueba a limpiar los 6 contactos que tiene con un poco de maña.....aunque creo que sólo se usa el 1 y 4º contacto)