Lo mejor es que encriptes el disco y le pongas contraseña al sistema, porque igualmente se puede extraer el disco, y conectándolo a otro ordenador, ver la información que hay dentro.
Otra solución sería comprar una caja con llave, si tanto te preocupa la privacidad y la intimidad.
Hacer el jumper a la placa o la peripecia que quieras hacer viene a ser lo mismo que sacar los cables que van del botón de encendido a la placa, lo entendería como método para joder a alguien, pero no para hacer lo que quieres, además que vas a tener que estar sacando la tapa, sacar jumper, etc...