Para comprobar si es el ventilador, en parado puedes meterle algo y mantenerlo parado, así determinas si el ruido viene de ahí o no.
Para controlarlo, tienes que desmontar la fuente, y sacar el conector por fuera, y mediante un splitter o alargador, llevarlo hasta placa. El conector no es el mismo, pero se puede conectar sin problema, yo lo llevo así desde que compré la fuente casi, que el de la mia haxe bastante ruido de stock.
(Aprovechando que tienes que abrir la fuente, puedes sacar el ventilador y mirar si lo unico que necesita es un poco de engrase/limpieza, y no necesitas controlarlo)
Luego con software como speedfan le puedes hacer una curva de ventilación que sea silenciosa, y si quieres, que suba algo con el calor de la gráfica, que va ser cuando mas va estar trabajando entregando mas potencia.
Puedes hacer lo mismo con un ventilador standar, mirando antes que ventilador lleva, normalmente llevan de 120.
Otra opcion es renovar la fuente, claro. Asegurandote que la que compras va ser silenciosa.