Ah, entonces solo es usar el sector 64 en el SDD como inicio de la primera particion, en lugar del sector 63 que emplean los discos duros, asi la alineacion del SSD es solo hacer un offset para recorrer un sector, mientras el disco este defragmentado no deberia tener mayor problema al reajustar la tabla de contenido, pero si esta fragmentrado le pasara lo de los programas que habra datos 'perdidos'.