El alternate se usa, aparte de para instalar ubuntu al "estilo debian", para actualizar la distribución, es decir, si sale una nueva versión de ubuntu se puede actualizar bajando el alternate (creo que con el Live-CD también se puede pero es más enrevesado; con el alternate "sale" directamente).
El Live-CD para la instalación gráfica. Una de las ventajas que tiene éste es que mientras se instala la distribución puedes navegar por Internet tranquilamente.