Yo es que tengo otro disipador distinto con mi R7 1700, que si le quitas el cable directamente no se iluminan los leds, el tuyo creo que tiene además otro cable USB, no sé si quitando ese cable ya deja de iluminar todos los leds, pruébalo por si acaso, dejándole conectado sólo el de 4 pines PWM que se encarga de hacer girar el ventilador.
Si con eso no se soluciona, pues algo que se me ocurre así a bote pronto, es que instales Windows y la APP de MSI, desactives la iluminación de los leds, y luego ya instales Linux, a ver si así te funciona bien.
Saludos.
