Buenas, a mi me pasaba y sino recuerdo mal lo solucione desactivando la opción en Panel de control -> Hardware y sonido-> Opciones de energía-> Elegir un plan de energía -> Cambiar la configuración del plan -> Cambiar la configuración avanzada de energía y en el menú que se te despliega buscas la opción que dice Configuración de usb y deshabilitas la opción Suspensión selectiva de usb.
También puedes trastear un poco por ese menú que creo que también hay algo para desactivar el encendido del pc a través del teclado.
Si con eso no te funciona también hay placas en las que se configuran los usb con el pc apagado o suspendido a traves de la BIOS, pero bueno prueba primero con eso para ir descartando...
Un saludo y suerte.
